土壤微生物是指在土壤中生活着的种类繁多的微生物，如细菌、放线菌、真菌、土壤藻类和微小动物等。土壤微生物有些对农业有益，有些却是有害的，土壤微生物是土壤中一个非常重要的组成成分，它对土壤性质、土壤肥力的形成及作物生长都有很重要的作用。首先，在土壤的形成中，其实质是土塘有机质的合成和分解，而有机质的合成和分解都有微生物的参与。微生物是土壤有机质积累的先锋，同时，有机质的分解更离不开微生物的作用。由于微生物分解有机质释放养分的作用，就将地壳中有限的营养元素能周而复始的利用，保证整个植物生长发育对养分无限的要求。在培肥土壤过程中使用各种措施使土壤更适于植物生长的要求，而这些措施主要靠微生物来参加作用。所以通过农业措施来培肥土壤的过程，即微生物改良技术，很多方面也就是调节土壤微生物活动的过程，如耕作、施肥、灌水、排水等措施都适当地调节了微生物的生态环境，促进有益微生物朝着培肥地力的方向发展，提高土壤肥力。
按照土壤性质分类改良措施
（1）黏性土土壤空气含量少，通透性差。这类土壤改良方式为：在掺沙的同时混入纤维含量高的作物秸秆、稻壳等发酵的微生物有机肥，可有效地改良此类土壤的通透性。
（2）沙性土保水、保肥性能差，有机质含量低，土表温度变化剧烈。这类土壤改良常采用“填淤”（掺入塘泥、河泥）结合增施纤维含量高的有机肥来改良。近年来国外已有使用“土壤结构改良剂”的报道。改良剂多为人工合成的高分子化合物，施用于沙性土壤作为保水剂或促使土壤形成团粒结构。在果树土壤改良中，果树要求团粒结构良好，土层深厚，水、肥、气、热协调的土壤，一般沙壤土、黏壤土都适合果树的栽培，但遇到理化性状较差的黏性土和沙性土时就需要用微生物有机肥进行土壤改良。
（3）盐碱地的改良盐碱地的主要危害是土壤含盐量高和离子毒害。当土壤的含盐量高于土壤含盐量的临界值0.2%，土壤溶液浓度过高，植物根系很难从中吸收水分和营养物质，引起“生理干旱”和营养缺乏症。另外盐碱地的土壤酸碱度高，一般pH值都在8以上，使土壤中各种营养物质的有效性降低。
改良的技术措施有：
①适时合理地灌溉，洗盐或以水压盐。
②多施微生物有机肥，种植绿肥作物如苜蓿、草木樨、百脉根、田菁、扁蓿豆、偃麦草、黑麦草、燕麦、绿豆等，以改善土壤不良结构，提高土壤中营养物质的有效性。
③施用土壤改良剂，提高土壤的团粒结构和保水性能。
④中耕（切断土表的毛细管），地表覆盖，减少地面过度蒸发，防止盐碱上升。
（4）黏重土壤的改良在我国长江以南的丘陵山区多为红壤土，土质极其黏重，容易板结，有机质含量少，且严重酸性化。
改良的技术措施有：
①掺沙，又称客土，一般1份黏土+两三份沙。
②增施微生物有机肥和广种绿肥作物，提高土壤肥力和调节酸碱度。但尽量避免施用酸性肥料，可用磷肥和石灰（750~1050kg/hm2）等。适用的绿肥作物有：肥田萝卜、紫云英、金光菊、豇豆、蚕豆、二月兰、大米草、毛叶苕子、油菜等。
③合理耕作，实施免耕或少耕，实施生草法等土壤管理。
（5）沙荒地的改良在我国黄河故道和西北地区有大面积的沙荒地，这些地域的土壤构成主要为沙粒，有机质极为缺乏，温、湿度变化大，无保水、保肥能力。
改良的技术措施有：
①设置防风林网，防风固沙。
②发掘灌溉水源，地表种植绿肥作物，加强覆盖。
③培土填淤与增施微生物有机肥结合。
④施用微生物土壤修复酵素肥和微生物土壤修复制剂改良土壤。
（6）土壤酸碱度的调节土壤的酸碱度对各种果树的生长发育影响很大，土壤中必需营养元素的可给性，土壤微生物的活动，根部吸水、吸肥的能力以及有害物质对根部的作用等，都与土壤pH值有关。梨的最适宜的土壤酸碱度为PH 5.5~8.5。 土壤过酸时可加入磷肥、适量石灰，或种植碱性绿肥作物如毛叶苕子、油菜等来调节；土壤偏碱时宜加入适量的硫酸亚铁，或种植酸性绿肥作物如苜蓿、草木樨、百脉根、黑麦草等来调节。 生态改良土壤，促进微生态循环，是当前土壤改良最行之有效的途径。如金益生菌土壤改良剂能够有效针对各种性质土壤，深入改良土壤性质，提高土壤肥力，逐年减少化肥、农药使用量，促进土壤团粒结构形成，连续三年使用能够彻底改善土壤生态、理化性质，实现免耕种植。
